Small RNA測序
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1 技術簡介
Small RNA是生命活動重要的調控因子，在基因表達調控、生物個體發(fā)育、代謝及疾病的發(fā)生等生理過程中起著重要的作用，包括miRNA、piRNA和siRNA。其中miRNA通過與靶mRNA特異性結合調控靶mRNA的表達，從而參與許多生命過程，如細胞增殖、 細胞凋亡、脂肪代謝和細胞分化等。Small RNA（sRNA）測序是利用高通量測序平臺檢測已知和未知miRNA的表達水平及其表達差異，結合同一樣本的轉錄組測序數(shù)據(jù)進行聯(lián)合分析，可以同時分析miRNA及其靶基因的表達情況，為研究small RNA功能及調控機制提供有力手段。
2 技術路線
3 樣品準備
樣本類型 | 組織樣品 | RNA |
樣本量 | 動物組織：＞ 2g； 植物組織：＞ 4g； 培養(yǎng)細胞：＞ 1×107 個； 血液樣品：≥ 2ml | 總RNA≥3μg, 濃度≥50ng/μI, OD260/280≥1.8-2.2, OD260/230≥2.0 |
送樣要求 | 送樣時請標記清楚樣品編號，管口使用Parafilm膜密封； | |
處理方式 | 取樣后直接速凍 | |
運輸方式 | 干冰寄送 | |
4 生信分析流程
5 主要結果展示
