宏基因組
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1 技術(shù)簡(jiǎn)介
宏基因組測(cè)序是一種利用高通量測(cè)序技術(shù)完成樣本中所有物種檢測(cè)和功能分析的測(cè)序方法。宏基因組測(cè)序技術(shù)無需進(jìn)行微生物的分離純化培養(yǎng)，就能夠快速有效地獲得整個(gè)微生物群落的基因信息，可以更加深入地對(duì)群落結(jié)構(gòu)、物種分類、系統(tǒng)進(jìn)化、基因功能及代謝網(wǎng)絡(luò)等方面進(jìn)行研究。
2 實(shí)驗(yàn)流程
3 樣本準(zhǔn)備
| 樣本類型 | 土壤/污泥 | 糞便 | 血液 |
| 樣本要求 | 1-5g | 1-5g | ≥2ml |
4 生信分析流程
5 分析結(jié)果展示（部分）
| 分析內(nèi)容 | 解決問題 |
| 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估 | 過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù)，保證數(shù)據(jù)質(zhì)量 |
| 基因預(yù)測(cè)、注釋 | 進(jìn)行基因預(yù)測(cè)及相關(guān)性分析 |
| 物種、功能組成分析 | 物種、基因功能注釋及相關(guān)分析 |
| 物種與功能差異分析 | 耐藥相關(guān)基因相關(guān)分析 |
| CAG／MLG分析 | 疾病和菌株關(guān)聯(lián)性研究 |
| CNV(copy number variation) | 菌株拷貝數(shù)變異與疾病關(guān)聯(lián)研究 |
| 噬菌體 | 噬菌體及前噬菌體預(yù)測(cè)及分析 |
高分文章必備：
Metagenome-scale analysis yields insights into the structure and function of microbial communities in a copper bioleaching heap
Schematic diagram of nitrogen metabolism in the surface-layer mine tailings representing one important part of bioleaching system.
