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1 技術(shù)簡(jiǎn)介
病毒基因組測(cè)序包括完成圖測(cè)序、掃描圖測(cè)序,通過(guò)二代/三代測(cè)序平臺(tái),獲得病毒的基因組的序列信息,并在結(jié)構(gòu)基因組學(xué)、比較基因組學(xué)層面通過(guò)差異分析、同源基因分析、共線性分析、物種進(jìn)化分析等手段探究病毒的毒力系統(tǒng)、基因組的進(jìn)化與演變歷程等。對(duì)于純化后的病毒,我們通過(guò)三代測(cè)序可以100%獲得該病毒的完整基因組序列。
3 樣本準(zhǔn)備
樣本類型 | 總量 | 濃度 | 完整性(膠圖) | 純度 |
基因組DNA/cDNA | 10~200 ng | ≥10 ng/μl | 存在主條帶 | 無(wú)蛋白,RNA/鹽離子等污染,樣本無(wú)色透明不粘稠 |
4 生信分析流程
5 分析結(jié)果展示(部分)