單細(xì)胞ATAC
1 技術(shù)簡介
單細(xì)胞ATAC-seq技術(shù)，全稱為單細(xì)胞轉(zhuǎn)座酶可接近染色質(zhì)測序技術(shù)（Single-Cell Assay for Transposase - Accessible Chromatin using sequencing）。通過將單個細(xì)胞分離并利用DNA轉(zhuǎn)座酶進行轉(zhuǎn)座反應(yīng)，然后對其進行測序，從而獲得單個細(xì)胞的染色質(zhì)開放區(qū)域的信息。這種方法可以解決細(xì)胞異質(zhì)性問題，揭示不同細(xì)胞之間的染色質(zhì)可及性差異和功能差異 。
圖1. 染色質(zhì)可及性 圖2. Tn5酶切割開放染色質(zhì)區(qū)域
2 技術(shù)原理
單細(xì)胞ATAC技術(shù)可在單細(xì)胞水平對細(xì)胞的染色質(zhì)開放區(qū)域進行檢測。首先，轉(zhuǎn)座酶進入細(xì)胞核，優(yōu)先在染色質(zhì)的開放區(qū)域切割 DNA，同時在 DNA片段的未端添加測序引物；其次，帶有條形碼的凝膠珠在油滴內(nèi)對每個細(xì)胞內(nèi)的 DNA片段進行 barcode 標(biāo)記，帶有 barcode 標(biāo)簽的 DNA 進行后續(xù)文庫構(gòu)建；最后，通過測序平臺對文庫進行測序檢測，即可一次性獲得大量單細(xì)胞的 DNA 染色質(zhì)開放區(qū)域數(shù)據(jù)。
圖3. 單細(xì)胞ATAC技術(shù)原理
單細(xì)胞多組學(xué) ATAC +轉(zhuǎn)錄組是一種以數(shù)千個細(xì)胞為研究對象，同時分析同一細(xì)胞中的基因表達和開放染色質(zhì)的技術(shù)，它可以帶來細(xì)胞的基因表達譜及其表觀基因組景觀的一體化視圖。這種分析不僅可以幫助識別不同類型的細(xì)胞，還能揭示決定細(xì)胞身份和行為的遺傳和表觀遺傳因素。這種綜合分析方法的應(yīng)用，極大地增強了科研工作者對細(xì)胞功能和調(diào)控機制的理解，特別是在復(fù)雜的生物體如人類中，這對于理解疾病的發(fā)生和發(fā)展具有重要意義。
圖3. 單細(xì)胞ATAC+單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理
3 樣品準(zhǔn)備
4 生物信息學(xué)分析流程
5 主要結(jié)果展示（只展示標(biāo)準(zhǔn)分析部分，具體項目具體分析，詳細(xì)請咨詢銷售）
差異peak分析