Hi-C 互作
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1 技術(shù)簡介
Hi-C技術(shù)以整個(gè)細(xì)胞核為研究對象，利用高通量測序技術(shù)，結(jié)合生物信息學(xué)方法，研究全基因組范圍內(nèi)整個(gè)染色質(zhì)DNA在空間位置上的關(guān)系；通過對染色質(zhì)內(nèi)全部DNA相互作用模式進(jìn)行捕獲，獲得高分辨率的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)信息，并與ChIP-seq、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)聯(lián)合分析，從基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和表觀遺傳網(wǎng)絡(luò)來闡述生物體性狀形成的相關(guān)機(jī)制。
2 實(shí)驗(yàn)流程
3 分析流程
4 主要結(jié)果
4.1 測序質(zhì)量評估
4.2 迭代比對及過濾
4.3 互作矩陣構(gòu)建及校正
4.4 TAD 結(jié)構(gòu)分析
4.5 顯著互作位點(diǎn)分析
4.6 樣本間顯著互作的比較
染色體結(jié)構(gòu)三維建模
兩樣本差異矩陣全局互作熱圖 
兩樣本TADs?Insulator差異圖
差異矩陣與多組學(xué)聯(lián)合展示圖
5 參考文獻(xiàn)
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