衣被天下、無(wú)棉不安—3個(gè)現(xiàn)代品種棉花高質(zhì)量基因組組裝和結(jié)構(gòu)變異挖掘
棉花是全球重要的可再生纖維作物,但由于基因型特異性以及品種、管理時(shí)間和環(huán)境因素之間的復(fù)雜相互作用,其產(chǎn)量和纖維品質(zhì)表現(xiàn)出了高度可變性。由于初始基因庫(kù)的狹窄,現(xiàn)代育種可能會(huì)限制未來(lái)棉花產(chǎn)量的增長(zhǎng)。依賴準(zhǔn)確的品種特異性數(shù)據(jù),精確育種和生物技的應(yīng)用為上述問(wèn)題提供了潛在的解決方案。因此,作者通過(guò)生成三個(gè)現(xiàn)代棉花品種(“UGA230”、“UA48”和“CSX8308”)的高質(zhì)量參考基因組并更新“TM-1”棉花基因組來(lái)滿足這一需求。分析結(jié)果顯示在四個(gè)基因組中觀察到相當(dāng)大的序列和結(jié)構(gòu)變異,這些變異與“Pima”棉花的基因組滲入、基因調(diào)控機(jī)制以及表型性狀分化有關(guān)。這些基因組和比較分析為未來(lái)提高全球棉花產(chǎn)量和可持續(xù)性的基因研究提供了寶貴的基礎(chǔ)?!ぁぁ?/p>