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公司動(dòng)態(tài)

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IF=10.1|跨物種 SV 分析在加速現(xiàn)代技術(shù)對(duì)農(nóng)場(chǎng)動(dòng)物性狀改良的可行性

家養(yǎng)動(dòng)物或農(nóng)作物在與其野生祖先分化時(shí)會(huì)經(jīng)歷類(lèi)似的表型轉(zhuǎn)變,這種現(xiàn)象被稱(chēng)為“馴化綜合征”。例如,與野生祖先相比,家畜在行為(如馴化)、形態(tài)(如被毛顏色)和生產(chǎn)(如高繁殖力)等方面的性狀都具有各種類(lèi)似的表型。然而,在馴化和隨后的遺傳改良過(guò)程中,驅(qū)動(dòng)物種間趨同進(jìn)化的遺傳變化仍不清楚。綿羊和山羊經(jīng)過(guò)馴化和改良,產(chǎn)生了相似的表型,而結(jié)構(gòu)變異 (SV) 對(duì)其影響很大。在這里,作者組裝了亞洲盤(pán)羊 (Ovis orientalis)(綿羊的野生祖先)的高質(zhì)量參考基因組。并利用全世界范圍內(nèi)野生和家養(yǎng)綿羊和山羊種群的879個(gè)全基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)解析了迄今為止最全面的綿羊?qū)俸蜕窖驅(qū)賁V景觀(guān)?;谠摂?shù)據(jù)集,作者利用 SV 對(duì)哺乳動(dòng)物的趨同進(jìn)化進(jìn)行了全面研究。作者篩選了基因組 SV 和相關(guān)基因在馴化和重要農(nóng)藝性狀改良過(guò)程中的選擇特征,還測(cè)試了 SV 從野生近緣種到家養(yǎng)種群的遺傳滲入,并評(píng)估了 SV 對(duì)開(kāi)放染色質(zhì)(ATAC-seq)和環(huán)境適應(yīng)的影響,以揭示趨同進(jìn)化背后的遺傳特征?!ぁぁ?/p>

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