Nat Rev Clin Oncol綜述 | 深入解析癌癥的空間組學(xué)景觀——機(jī)遇與挑戰(zhàn)并存
空間生物學(xué)的概念由來已久，幾十年來，科研人員利用顯微鏡獲取腫瘤的空間信息，依靠基于靶向蛋白質(zhì)的技術(shù)對(duì)腫瘤進(jìn)行表征，如免疫組織化學(xué)（IHC）和免疫熒光等，揭示了具有預(yù)測(cè)和/或預(yù)后價(jià)值的組織學(xué)模式。但這些技術(shù)需預(yù)先選擇靶分子、分辨率有限并存在因樣本選擇導(dǎo)致的偏差問題。此外，基因組學(xué)的進(jìn)步在提高癌癥診斷和預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性以及指導(dǎo)新治療方法方面顯示出越來越大的效用，但許多基因組學(xué)方法未能完全捕獲樣本的潛在細(xì)胞異質(zhì)性。在過去十年中，單細(xì)胞基因組學(xué)方法（單細(xì)胞RNA測(cè)序，scRNA-seq）的進(jìn)步為腫瘤復(fù)雜的細(xì)胞和分子景觀提供了廣泛的見解，但其缺乏空間背景，無法獲取組織結(jié)構(gòu)和細(xì)胞相互作用的基本信息。目前，人們已開發(fā)了一系列空間分析技術(shù)來表征基因組、轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組；特別地，空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)的出現(xiàn)在一定程度上彌補(bǔ)了上述缺陷，其提供了空間分辨轉(zhuǎn)錄組學(xué)（SRT）數(shù)據(jù)，在探索腫瘤空間結(jié)構(gòu)和腫瘤微環(huán)境（TME）中發(fā)揮著重要作用。已有研究表明，空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)可在亞細(xì)胞空間分辨率上解析基因表達(dá)，揭示具有臨床意義的生物學(xué)新發(fā)現(xiàn)?！ぁぁ?/p>
